Atsuko, une jeune psychiatre détective surnommée Paprika, a une méthode toute particulière pour parvenir à arrêter les criminels et soigner ses patients. Pour comprendre leurs psychoses, elle infiltre leurs rêves... Mais une grande multinationale lui dérobe sa trouvaille et l'utilise à mauvais escient. Avant que la situation ne dégénère, Paprika décide de mener l'enquête pour découvrir quelles sont les raisons de ce vol et qui est la personne qui l'a perpétré...