Au nord du Texas, un jeune garçon découvre dans une grotte des ossements préhistoriques. A leur contact, un mystérieux parasite "l'huile noire", pénètre dans sa peau et envahit son organisme. Le corps de l'enfant est évacué avant l'arrivée des secours. Mulder et Scully vont bientôt découvrir un projet de guerre bactériologique par la propagation d'un virus. Le nord du Texas servirait de champ d'expérimentation....