Alice a survécu à l'effroyable cauchemar qui a dévasté le complexe scientifique ultrasecret d'Umbrella Corporation, mais entre-temps le virus mortel s'est abattu sur la ville de Raccoon condamnant la quasi totalité de ses habitants.
Avec un groupe de survivants, Alice, dont le métabolisme a mystérieusement été modifié, doit affronter le pire. Certes, elle a gagné de nouveaux pouvoirs, elle est plus puissante, ses sens sont surmultipliés et sa dextérité est hallucinante, mais cela sera-t'il suffisant pour affronter Némésis, son pire cauchemar ?