John Hammond, milliardaire fantasque, vient d'accomplir une prouesse : à partir d'une goutte de sang absorbée par un moustique fossilisé, lui et son équipe sont parvenus à recréer une dizaine d'espèces de dinosaures. Non content d'avoir mené à bien ce projet, le vieil homme s'est décidé à le rentabiliser en ouvrant, sur une île, le plus grand parc à thème du monde : Jurassic Park. A l'aide de quelques spécialistes, il règle les derniers détails avant l'ouverture du parc. Mais si avant tout ça, dinosaures et humains n'avaient jamais cohabités, il y avait sans doute une raison...

Malgré le fiasco complet de son Jurassic Park, le milliardaire John Hammond persiste dans ses et signe : il rappelle le Dr Ian Malcolm pour un nouveau projet. Sur une île déserte voisine du parc, des centaines de dinosaures de toutes tailles et de toutes espèces, descendants des animaux clônés en laboratoire, ont survécu. D'abord réticent, Ian se décide à faire partie de l'expédition scientifique. Il ignore qu'une autre expédition moins bien intentionnée est également en route.

Alan étudie les vélociraptors. Cependant, il manque de subventions. Paul Kirby lui propose alors une grosse somme d'argent s'il leur fait survoler la fameuse île où dix ans auparavant il a été confronté à ces dinosaures ramenés à la vie. Il accepte mais flaire une entourloupe quand le pilote amorce sa descente sur l'île. En fait Kirby voudrait qu'Allan sauve leur fils disparu dans les environs...